Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sf3b2Q3UJB0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms