Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Arfgef3Q3UGY8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms