Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Srsf6Q3TWW8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms