Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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