Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TQQ9 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TQQ9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TQQ9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TQQ9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TQQ9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TQQ9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TQQ9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TQQ9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TQQ9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TQQ9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TQQ9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TQQ9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TQQ9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TQQ9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TQQ9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TQQ9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TQQ9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TQQ9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TQQ9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q3TQQ9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3TQQ9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3TQQ9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3TQQ9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3TQQ9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3TQQ9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q3TQQ9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q3TQQ9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q3TQQ9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TQQ9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TQQ9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TQQ9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q3TQQ9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TQQ9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TQQ9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TQQ9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TQQ9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q3TQQ9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TQQ9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TQQ9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TQQ9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TQQ9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TQQ9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TQQ9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q3TQQ9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q3TQQ9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms