Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Uri1Q3TLD5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uri1Q3TLD5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uri1Q3TLD5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uri1Q3TLD5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uri1Q3TLD5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uri1Q3TLD5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uri1Q3TLD5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uri1Q3TLD5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uri1Q3TLD5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uri1Q3TLD5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uri1Q3TLD5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uri1Q3TLD5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uri1Q3TLD5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uri1Q3TLD5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uri1Q3TLD5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Uri1Q3TLD5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uri1Q3TLD5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uri1Q3TLD5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uri1Q3TLD5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Uri1Q3TLD5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Uri1Q3TLD5 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms