Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Trappc13Q3TIR1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trappc13Q3TIR1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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