Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trim71Q1PSW8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms