Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrriq1Q0P5X1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrriq1Q0P5X1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms