Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SobpQ0P5V2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SobpQ0P5V2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms