Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubxn2bQ0KL01 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms