Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc7a1Q09143 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Slc7a1Q09143 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms