Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPINDOCQ05AH6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPINDOCQ05AH6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms