Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GscQ02591 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GscQ02591 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GscQ02591 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GscQ02591 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GscQ02591 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GscQ02591 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GscQ02591 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GscQ02591 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GscQ02591 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GscQ02591 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GscQ02591 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GscQ02591 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GscQ02591 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GscQ02591 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GscQ02591 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GscQ02591 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GscQ02591 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GscQ02591 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GscQ02591 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GscQ02591 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GscQ02591 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GscQ02591 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GscQ02591 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GscQ02591 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GscQ02591 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms