Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HmgcrQ01237 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms