Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
PrcdQ00LT2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms