Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SeleQ00690 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms