Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
rp9P97762 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
rp9P97762 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
rp9P97762 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
rp9P97762 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
rp9P97762 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
rp9P97762 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
rp9P97762 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
rp9P97762 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
rp9P97762 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
rp9P97762 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms