Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pkp1P97350 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms