Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Mesp1P97309 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms