Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gabpb2P81069 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gabpb2P81069 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gabpb2P81069 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gabpb2P81069 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms