Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tp53bp1P70399 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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