Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cux2P70298 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cux2P70298 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cux2P70298 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cux2P70298 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cux2P70298 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms