Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tubb4bP68372 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms