Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl23P62830 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms