Protein–RNA interactions for Protein: P59113

Fermt1, Fermitin family homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fermt1P59113 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fermt1P59113 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms