Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TdgP56581 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TdgP56581 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TdgP56581 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TdgP56581 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TdgP56581 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TdgP56581 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TdgP56581 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TdgP56581 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TdgP56581 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TdgP56581 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TdgP56581 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TdgP56581 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TdgP56581 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TdgP56581 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TdgP56581 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TdgP56581 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TdgP56581 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TdgP56581 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TdgP56581 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TdgP56581 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TdgP56581 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TdgP56581 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TdgP56581 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TdgP56581 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TdgP56581 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TdgP56581 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TdgP56581 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TdgP56581 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TdgP56581 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TdgP56581 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TdgP56581 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TdgP56581 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TdgP56581 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TdgP56581 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TdgP56581 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TdgP56581 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TdgP56581 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TdgP56581 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TdgP56581 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TdgP56581 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TdgP56581 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TdgP56581 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TdgP56581 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TdgP56581 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TdgP56581 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TdgP56581 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TdgP56581 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TdgP56581 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TdgP56581 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TdgP56581 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TdgP56581 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TdgP56581 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TdgP56581 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TdgP56581 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TdgP56581 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TdgP56581 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TdgP56581 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TdgP56581 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TdgP56581 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TdgP56581 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TdgP56581 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TdgP56581 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TdgP56581 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TdgP56581 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TdgP56581 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TdgP56581 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms