Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ephb4P54761 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ephb4P54761 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ephb4P54761 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms