Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CcnfP51944 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CcnfP51944 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnfP51944 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CcnfP51944 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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