Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnnt2P50752 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms