Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SftpdP50404 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SftpdP50404 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SftpdP50404 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SftpdP50404 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SftpdP50404 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SftpdP50404 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpdP50404 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpdP50404 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpdP50404 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpdP50404 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpdP50404 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpdP50404 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpdP50404 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpdP50404 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SftpdP50404 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpdP50404 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SftpdP50404 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpdP50404 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SftpdP50404 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SftpdP50404 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SftpdP50404 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SftpdP50404 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SftpdP50404 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpdP50404 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SftpdP50404 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SftpdP50404 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SftpdP50404 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms