Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CitP49025 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CitP49025 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CitP49025 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CitP49025 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CitP49025 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CitP49025 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CitP49025 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CitP49025 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CitP49025 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CitP49025 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CitP49025 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CitP49025 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CitP49025 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CitP49025 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CitP49025 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CitP49025 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CitP49025 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CitP49025 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CitP49025 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CitP49025 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CitP49025 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CitP49025 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CitP49025 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CitP49025 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CitP49025 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CitP49025 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CitP49025 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CitP49025 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CitP49025 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CitP49025 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CitP49025 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CitP49025 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms