Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnni3P48787 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms