Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Epb41P48193 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Epb41P48193 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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