Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PtprkP35822 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprkP35822 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprkP35822 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprkP35822 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprkP35822 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprkP35822 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprkP35822 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprkP35822 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PtprkP35822 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms