Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Kif5cP28738 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kif5cP28738 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kif5cP28738 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kif5cP28738 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kif5cP28738 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kif5cP28738 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kif5cP28738 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kif5cP28738 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kif5cP28738 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kif5cP28738 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kif5cP28738 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kif5cP28738 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kif5cP28738 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kif5cP28738 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kif5cP28738 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kif5cP28738 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kif5cP28738 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kif5cP28738 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kif5cP28738 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Kif5cP28738 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kif5cP28738 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kif5cP28738 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Kif5cP28738 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Kif5cP28738 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Kif5cP28738 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif5cP28738 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Kif5cP28738 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif5cP28738 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif5cP28738 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Kif5cP28738 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Kif5cP28738 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Kif5cP28738 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Kif5cP28738 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms