Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpl3P27659 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpl3P27659 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms