Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NefhP19246 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NefhP19246 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NefhP19246 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NefhP19246 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NefhP19246 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NefhP19246 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NefhP19246 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NefhP19246 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NefhP19246 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NefhP19246 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NefhP19246 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NefhP19246 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NefhP19246 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NefhP19246 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NefhP19246 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NefhP19246 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NefhP19246 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NefhP19246 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NefhP19246 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NefhP19246 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NefhP19246 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NefhP19246 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NefhP19246 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NefhP19246 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NefhP19246 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NefhP19246 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NefhP19246 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NefhP19246 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NefhP19246 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NefhP19246 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NefhP19246 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NefhP19246 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NefhP19246 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NefhP19246 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NefhP19246 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NefhP19246 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NefhP19246 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NefhP19246 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NefhP19246 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NefhP19246 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NefhP19246 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NefhP19246 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NefhP19246 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NefhP19246 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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