Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnnc1P19123 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnnc1P19123 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms