Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PrphP15331 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrphP15331 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrphP15331 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrphP15331 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrphP15331 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrphP15331 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms