Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lamp1P11438 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lamp1P11438 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lamp1P11438 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lamp1P11438 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lamp1P11438 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lamp1P11438 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lamp1P11438 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lamp1P11438 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lamp1P11438 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lamp1P11438 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms