Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP11369 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP11369 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP11369 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP11369 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP11369 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP11369 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP11369 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP11369 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP11369 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PolP11369 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PolP11369 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP11369 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP11369 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP11369 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP11369 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP11369 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP11369 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP11369 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP11369 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP11369 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP11369 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP11369 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP11369 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP11369 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP11369 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP11369 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP11369 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP11369 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP11369 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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PolP11369 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP11369 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP11369 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP11369 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP11369 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP11369 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP11369 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP11369 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PolP11369 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PolP11369 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms