Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms