Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P04212 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P04212 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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