Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01734 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01734 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01734 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01734 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01734 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01734 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01734 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01734 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01734 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01734 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01734 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01734 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01734 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01734 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01734 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01734 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01734 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01734 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01734 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01734 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01734 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01734 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01734 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01734 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01734 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01734 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01734 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01734 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01734 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01734 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01734 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01734 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01734 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01734 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01734 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01734 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01734 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01734 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01734 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01734 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms