Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
AurkcO88445 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
AurkcO88445 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms