Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlkO54988 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlkO54988 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlkO54988 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlkO54988 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlkO54988 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlkO54988 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlkO54988 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlkO54988 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlkO54988 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlkO54988 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlkO54988 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlkO54988 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlkO54988 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SlkO54988 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlkO54988 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlkO54988 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlkO54988 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlkO54988 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlkO54988 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlkO54988 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SlkO54988 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlkO54988 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlkO54988 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlkO54988 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SlkO54988 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SlkO54988 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SlkO54988 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlkO54988 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlkO54988 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlkO54988 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SlkO54988 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SlkO54988 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlkO54988 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlkO54988 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlkO54988 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlkO54988 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlkO54988 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SlkO54988 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlkO54988 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlkO54988 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlkO54988 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlkO54988 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlkO54988 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlkO54988 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlkO54988 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SlkO54988 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms