Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Csnk2a2O54833 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms