Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms