Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ptch2O35595 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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